TY  - JOUR
A1  - Avtzis, Dimitrios N.
A1  - Arthofer, Wolfgang
A1  - Stauffer, Christian
T1  - Identifying haplotypes of Pityogenes chalcographus (Col., Scolytidae) by Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP)
T1  - Identifizierung von Haplotypen bei Pityogenes chalcographus (Col., Scolytidae) durch SSCP
T2  - Mitteilungen der Deutschen Gesellschaft für Allgemeine und Angewandte Entomologie
N2  - Pityogenes chalcographus is a widely distributed spruce pest in Eurasia (KNIZEK et al. 2005). In 70ies, E. Führer studied the intraspecific variation of this spruce bark beetle and detected race differentiation among European populations based on crossing experiments (FÜHRER 1977), morphological characters FÜHRER 1978) and allozyme electrophoresis (RITZENGRUBER 1990). In order to verify the hypothesis differentiation, we analysed diverse European P. chalcographus populations using the Cytochrome Oxidase gene (COI) of the mitochondrial DNA. The complete COI gene of 96 individuals was sequenced. In facilitate the screening of the European populations, we applied a PCR-SSCP method. This polyacrylamide electrophoresis technique offers a sensitive but inexpensive, rapid and convenient method for detecting polymorphisms, reducing the amount of samples that require sequencing (SUNNUCKS et al. 2000).
N2  - Der Kupferstecher Pityogenes chalcographus (Coleoptera, Scolytidae) gehört zu den am weitesten verbreiteten Borkenkäfern Europas. Käferpopulationen aus verschiedenen Gebieten Europas zeigten eine hohe Divergenz hinsichtlich der Nukleotidzusammensetzung des mitochondrialen Cytochrom Oxidase I Gens. Die Unterschiede betragen bis zu 2,26% zwischen einzelnen Herkünften. Die phylogenetische Auswertung der Sequenzen des kompletten Gens (1503bp) ergab einen 6-astigen Baum mit insgesamt 34 Haplotypen. Ausgehend von dieser Struktur wurden Primerpaare entworfen, um jeweils etwa 250 bp lange mutationsreiche Abschnitte des COI Gens zu amplifizieren. Die PCR Produkte wurden mittels Single Strand Conformation Polymorphism (SSCP) untersucht. Zwischen den einzelnen Haplotypen konnten zahlreiche Polymorphismen erkannt werden. Diese eignen sich als schnelles Werkzeug zum screening einzelner Individuen und verringern signifikant die Notwendigkeit klassischer Sequenzierreaktionen.
KW  - Scolytidae
KW  - Pityogenes
KW  - SSCP
KW  - Phylogeographie
KW  - mitochondriale DNA
KW  - Scolytidae
KW  - Pityogenes
KW  - SSCP
KW  - phylogeography
KW  - mitochondrial DNA
KW  - PAGE
Y1  - 2006
UR  - http://publikationen.ub.uni-frankfurt.de/frontdoor/index/index/docId/19840
UR  - https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:hebis:30-1103236
SN  - 0344-9084
VL  - 15
SP  - 173
EP  - 176
PB  - Deutsche Gesellschaft für Allgemeine und Angewandte Entomologie
CY  - Gießen
ER  -