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Adaptive modeling of biochemical pathways

  • In bioinformatics, biochemical pathways can be modeled by many differential equations. It is still an open problem how to fit the huge amount of parameters of the equations to the available data. Here, the approach of systematically learning the parameters is necessary. In this paper, for the small, important example of inflammation modeling a network is constructed and different learning algorithms are proposed. It turned out that due to the nonlinear dynamics evolutionary approaches are necessary to fit the parameters for sparse, given data. Keywords: model parameter adaption, septic shock. coupled differential equations, genetic algorithm.

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Metadaten
Verfasserangaben:Rüdiger W. BrauseGND
URN:urn:nbn:de:hebis:30-79299
Titel des übergeordneten Werkes (Deutsch):International Journal on Artificial Intelligence Tools
Dokumentart:Wissenschaftlicher Artikel
Sprache:Englisch
Datum der Veröffentlichung (online):08.09.2010
Jahr der Erstveröffentlichung:2004
Veröffentlichende Institution:Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg
Datum der Freischaltung:08.09.2010
Freies Schlagwort / Tag:coupled differential equations; genetic algorithm; model parameter adaption; septic shock
Jahrgang:13
Erste Seite:851
Letzte Seite:862
Quelle:International Journal on Artificial Intelligence Tools, 13, S. 851-862
HeBIS-PPN:228107857
Institute:Informatik und Mathematik / Informatik
DDC-Klassifikation:0 Informatik, Informationswissenschaft, allgemeine Werke / 00 Informatik, Wissen, Systeme / 004 Datenverarbeitung; Informatik
Sammlungen:Universitätspublikationen
Lizenz (Deutsch):License LogoDeutsches Urheberrecht