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Identification and characterization of hypoxia-regulated long non-coding RNAs in endothelial cells

  • RNA deep sequencing of the human transcriptome revealed that almost ~84 % of the genome are transcribed, however, only 2 % of all transcripts encode for proteins. All remaining transcripts are referred to as non-coding RNAs and can be divided into small non-coding RNAs (<200 nt) and long non-coding RNAs (lncRNAs; >200 nt). Studies throughout the last decade suggest a broad functional spectrum for lncRNAs. Regarding the cardiovascular field, several studies could show that lncRNAs are implicated in various aspects of endothelial cell biology. The response to hypoxia and the regulation of angiogenesis are key events in the context of several diseases. Therefore, the aim of this study was to determine the influence of hypoxia on lncRNA expression in human umbilical vein endothelial cells and furthermore, to characterize the lncRNA function on a molecular level. ...
  • Durch die Sequenzierung des humanen Genoms und Transkriptoms konnte gezeigt werden, dass ~80 % des humanen Genoms transkribiert werden. Erstaunlicherweise kodieren nur 2 % aller Transkripte für Proteine. Der weitaus größere Anteil der Transkripte wird der Klasse der nicht-kodierenden RNA (non-coding RNA) zugeordnet, welche wiederum in kurze nicht-kodierende (small non-coding; <200 nt)) und lange nicht-kodierende RNA (long non-coding, lncRNA; >200 nt) aufgeteilt wird. Durch eine Vielzahl an Studien konnte gezeigt werden, dass lncRNAs ein großes Spektrum an Funktionen besitzen. In der kardiovaskulären Forschung konnten einzelne Studien aufzeigen, dass lncRNAs wichtige Funktionen innerhalb der Endothelzellbiologie einnehmen und auf unterschiedlichen Ebenen regulatorische Funktionen ausüben. Die zelluläre Antwort auf eine hypoxische Umgebung sowie die regulatorischen Prozesse während der Angiogenese nehmen eine Schlüsselrolle in zahlreichen Krankheiten ein. Der Prozess der Angiogenese beschreibt die Neubildung von Blutgefäßen aus bereits bestehenden. Hierfür sprossen Endothelzellen, stimuliert durch Hypoxie und Wachstumsfaktoren wie z.B. VEGFA (vascular endothelial growth factor A) in Richtung des hypoxischen Milieus aus, mit dem Ziel diese Region wieder mit Sauerstoff zu versorgen. Unter physiologischen Bedingungen nimmt die Angiogenese eine besondere Rolle während der Wundheilung, Ischämie, Embryonalentwicklung oder der Schwangerschaft ein. Weiterhin ist der Prozess der Angiogenese unter pathologischen Bedingungen wie Tumorwachstum, Diabetes oder Endometriose von Bedeutung. ...

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Metadaten
Author:Philipp Neumann
URN:urn:nbn:de:hebis:30:3-486405
Referee:Stefanie DimmelerORCiDGND, Michaela Müller-McNicollORCiD
Advisor:Michaela Müller-McNicoll
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Year of Completion:2018
Year of first Publication:2018
Publishing Institution:Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg
Granting Institution:Johann Wolfgang Goethe-Universität
Date of final exam:2018/11/30
Release Date:2020/04/08
Page Number:143
HeBIS-PPN:46374490X
Institutes:Biowissenschaften / Biowissenschaften
Dewey Decimal Classification:5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie
Sammlungen:Universitätspublikationen
Licence (German):License LogoDeutsches Urheberrecht