Dynamic microsatellites in transcribed regions of gastropod mitochondrial 16S rDNA

  • Length variations of repetitive sequences in different AT-rich loop-coding regions of mitochondrial 16S rDNA in two gastropod species were discovered during intraspecific haplotype surveys. Examination of the discrete length variation of the basic repeat unit in a phylogenetic framework led to the conclusion of a microsatellite-like mutational dynamic. The observations suggest that the presence of a repetitive sequence structure alone is sufficient to trigger this dynamic.
  • Des variations quant à la longueur de séquences répétitives au sein de diverses régions codantes à boucle AT-riche du gène codant pour l’ADNr 16S mitochondrial ont été découvertes chez deux gastéropodes lors de la comparaison d’haplotypes interspécifiques. Le fait que cette variation de taille, de type discrète, impliquait la perte ou le gain de monomères de la séquence répétitive a été interprété dans un contexte phylogénétique. Il en ressort que cette variation s’apparente à une dynamique mutationnelle analogue à celle des microsatellites. Ces observations suggèrent que la présence d’une structure formée de séquences répétitives suffit, à elle seule, à enclencher ce genre de dynamique. Mots clés : microsatellites, ARNr 16S, génome mitochondrial, ADN répétitif, gastéropodes.

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Verfasserangaben:Markus PfenningerORCiDGND, Monika Bugert
URN:urn:nbn:de:hebis:30-34966
DOI:https://doi.org/10.1139/gen-44-2-163
Titel des übergeordneten Werkes (Englisch):Genome
Verlag:NRC Research Press
Verlagsort:Ottawa
Dokumentart:Wissenschaftlicher Artikel
Sprache:Englisch
Datum der Veröffentlichung (online):07.12.2006
Jahr der Erstveröffentlichung:2001
Veröffentlichende Institution:Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg
Datum der Freischaltung:07.12.2006
Freies Schlagwort / Tag:16S rRNA; gastropods; microsatellites; mitochondrial genome; repetitive DNA
Jahrgang:44
Ausgabe / Heft:2
Seitenzahl:4
Erste Seite:1
Letzte Seite:4
HeBIS-PPN:288829387
Institute:Biowissenschaften / Biowissenschaften
DDC-Klassifikation:5 Naturwissenschaften und Mathematik / 59 Tiere (Zoologie) / 590 Tiere (Zoologie)
Sammlungen:Sammlung Biologie / Sondersammelgebiets-Volltexte
Lizenz (Deutsch):License LogoDeutsches Urheberrecht