TY  - THES
A1  - Schmidt, Andreas
T1  - Investigation of structural dynamics of H/ACA RNPs by smFRET spectroscopy & design and applications of versatile small molecule dependent RNA of interest release platform
N2  - This dissertation contains two chapters. Each chapter covers a unique topic within RNA science and is divided in two sub sections, part A and B. Each chapter contains an introduction.
Chapter 1 gives an insight into challenges encountered during sample design and preparation for single molecule Förster energy transfer (smFRET) spectroscopy and offers a solution via a newly establishedestablished workflow to obtain accurate smFRET constructs. Following this workflow, a FRET network could be generated, which allowed a detailed structural dynamics study on H/ACA RNP during catalysis with smFRET spectroscopy. This led to detailed mechanistic insights into H/ACA RNPs dynamics during catalysis.
Chapter 2 deals with RNA synthetic biology whereby a novel eclectic design strategy for RNA of interest (ROI) release platform is presented, which allows to release a diverse ROI sequences with single nucleotide precision triggered by an external stimulus. This design strategy was used to establish a ROI release system and its powerful performance in in vitro and in vivo applications was shown.
N2  - Diese Dissertation enthält zwei Kapitel, jedes deckt ein individuelles Themengebiet der RNA Wissenschaften ab und ist in zwei Unterabschnitte aufgeteilt, Teil A und B, wobei jedes Kapitel eine Einführung enthält.
Kapitel 1 gibt einen Einblick in die Herausforderungen bei dem Probendesign und der Vorbereitung für die Einzelmolekül Förster Resonanz Energietransfer (smFRET)-Spektroskopie dar und bietet eine Lösung durch einen neu etablierten workflow an, um smFRET-Konstrukte mit hoher Distanzpräzision zu erhalten. Basierend auf diesem workflow konnte ein FRET-Netzwerk generiert werden, welches eine detaillierte strukturdynamische Untersuchung vom H/ACA Ribonukleoproteinen (H/ACA RNPs) während der Katalyse mit smFRET-Spektroskopie ermöglicht. Dies führte zu detaillierten mechanistischen Erkenntnissen über die Dynamik von H/ACA RNP während der Katalyse.
Kapitel 2 beschäftigt sich mit der synthetischen RNA-Biologie, wobei eine neuartige Designstrategie für eine RNA von Interesse (ROI)-Freisetzungsplattform vorgestellt wird, welche durch einen externen Stimulus diverse ROI-Sequenzen mit Einzel-Nukleotid-Präzision freizusetzen kann. Diese Design-Strategie wurde angewandt und eine ROI-Freisetzungsplattform generiert. Die Leistungsfähigkeit des Systems wurde in in vitro- und in vivo-Anwendungen demonstriert.
Y1  - 2019
UR  - http://publikationen.ub.uni-frankfurt.de/frontdoor/index/index/docId/52725
UR  - https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:hebis:30:3-527255
N1  - Diese Dissertation steht außerhalb der Universitätsbibliothek leider (aus urheberrechtlichen Gründen) nicht im Volltext zur Verfügung, die CD-ROM kann (auch über Fernleihe) bei der UB Frankfurt am Main ausgeliehen werden.
ER  -