TY  - THES
A1  - Beyer, Tilo
T1  - Spatio-temporal dynamics of primary lymphoid follicles during organogenesis and lymphneogenesis
T1  - Raum-zeitliche Dynamik von primären Lymphoiden-Follikeln während der Organogenese und Lymphneogenese
N2  - Primary lymphoid follicles are structures which are important for adaptive immune responses in mammals. Within the follicles follicular dendritic cells (FDC) are maintained by constant stimuli provided by B cells. It is thought that the FDC are important for immune response. It is of interest to know how lymphoid follicles are regulated in order to understand their role in various autoimmune diseases in which these follicles are created ectopically. With the help of a tissue simulation relying on an agent-based cell model on top of a regular triangulation various scenarios suggested by the available experimental data have been investigated. In order to cope with the complexity in the simulation of immune tissue the regular triangulation has been implemented for the use on parallel computers. The algorithms for kinetic and dynamic regular triangulation have been created newly. Also the cell model underlying the simulation has been designed newly in many aspects. The simulations allowed to identify common factors that regulate the formation of lymphoid follicles normally during organogenesis in development and lymphneogenesis in the course of diseases. The generation of FDC from local stromal populations under the influence of B cell aggregates is shown to be possible with the given experimental parameters. The sequence of the organogenesis and lymphneogenesis can be described with regard to the morphology of the B and T zone. Tests for the stability of the primary lymphoid follicle system constraints the regulation of the B cell efflux. The required lymphatic vessels around the lymphoid follicle are shown to be negatively correlated with the FDC network. Moreover it is shown that the adjacent T zone consisting of its own stromal population and T cells has similar regulation principles. This easily explains the intermediate ring of B cells found around the T zone during development and certain signaling molecule deficiencies. A major result of this thesis is that the generation of FDC needs negative regulation while a number of other possible mechanisms is incompatible with the available experimental data. Moreover the observed microanatomy was brought into a functional relationship with data on the cellular level finally culminating in the proposal of new experiments that shed light on the dynamics of the primary lymphoid follicle. One conclusion is that the FDC directly or indirectly influence the angiogenesis and lymphangiogenesis processes in secondary lymphoid tissues. The work presented here may help to guide experiments with the help of computers in order to reduce the amount of experiments and design them in a way to maximize the amount of information about biological systems.
N2  - In Säugetieren spielen primäre lymphoide Follikel eine wichtige Rolle bei der adaptiven Immunantwort. Innerhalb der Follikel werden follikuläre dendritische Zellen (FDZ) durch eine konstante Stimulation durch B-Zellen generiert und erhalten. Diese FDZ-Population is wichtig für bestimmte Immunreaktionen. Die Erzeugung und Regulierung der Follikel is interessant insbesondere im Hinblick auf ihre ektopische Erzeugung im Laufe von Autoimmunreaktionen. Mit Hilfe von Gewebesimulationen ausgehend von einem Individual-basierten Zellmodells, das auf einer Delaunay-Triangulation aufbaut, wurden verschiedene aus Experimenten generierter Szenarien untersucht. Zur Lösung des Komplexitäts-Problems der vielen zu simulierende Zellen des Gewebes wurde größtenteils neue Algorithmen zur parallelen Verarbeitung der Kinetik und Dynamik der Delaunay-Triangulation erstellt. Das darauf aufbauende Zellmodell ist ebenfalls der parallelen Verarbeitung angepaßt. Die Simulationen führten zur Identifizierung gemeinsamer Zusammenhänge der Regulation lymphoider Follikel währen der Organogenese und der krankheitsbedingten Lymphneogenese. Die Erzeugung von FDZ aus lokalen Populationen stromaler Zellen durch Aggregate von B-Lypmozyten ist im Bereich der experimentellen Parameter möglich. Die Sequenz der Musterbildung von B- und T-Zone des Follikels während Organogenese und Lymphneogenese kann simuliert werden. Stabilitätskriterien für das primäre lymphoide Follikel schränken die möglichen Mechanismen der Regulation des B-Lymphozyten-Efflux ein. Die dafür notwendigen lymphatischen Gefäße um das Follikel sind negativ mit den FDZ korreliert, um eine Position um das Follikel herum einzunehmen. Ebenso wird gezeigt, das die spezifischen stromalen Populationen der T-Zone zusammen mit den T-Lymphozyten ähnlichen Organisationsprinzipien gehorchen, wie das benachbarte Follikel. Dies erklärt auf einfache Weise, das Auftreten einer charakteristischen intermediären Morphologie des Follikels als B-Lymphozyten-Ring um die T-Zone sowohl während der normalen Entwicklung als auch als Resultat bestimmter Signalmolekül-Defizite. Ein zentrales Ergebnis dieser Arbeit ist, dass die Erzeugung der FDZ einer negativen Regulation unterliegen muss, während eine Reihe anderer denkbarer Mechanismen nicht mit den verfügbaren experimentellen Daten in Einklang zu bringen ist. Darüber hinaus konnten Morphologie und Funktion mit Daten der zellulären Ebene in Beziehung gesetzt werden. Daraus sind neue Experimente zur Dynamik primärer lymphoider Follikel abgeleitet worden. Ein Beispiel hierfü ist der Einfluss der FDZ auf die Angiogenese und Lymphangiogenese in sekundären lymphoiden Geweben. Die hier aufgeführte Arbeit stellt so einen Beitrag dar, Experimente mit Hilfe von Computer Simulationen zu entwerfen, um sowohl die Zahl der notwendigen Experimente zu reduzieren als auch deren Informationsgewinn über ein biologisches System zu maximieren.
KW  - Immunologie
KW  - Organogenese
KW  - Delaunay-Triangulierung
KW  - Voronoi-Diagramm
KW  - Parallelverarbeitung
KW  - B-Lymphozyt
KW  - T-Lymphozyt
KW  - Lymphknoten
KW  - Follikuläre dendritische Zellen
KW  - Biomechanik
KW  - follicular dendritic cells
KW  - biomechanics
Y1  - 2007
UR  - http://publikationen.ub.uni-frankfurt.de/frontdoor/index/index/docId/5628
UR  - https://nbn-resolving.org/urn:nbn:de:hebis:30-54989
ER  -