Dynamic microsatellites in transcribed regions of gastropod mitochondrial 16S rDNA
- Length variations of repetitive sequences in different AT-rich loop-coding regions of mitochondrial 16S rDNA in two gastropod species were discovered during intraspecific haplotype surveys. Examination of the discrete length variation of the basic repeat unit in a phylogenetic framework led to the conclusion of a microsatellite-like mutational dynamic. The observations suggest that the presence of a repetitive sequence structure alone is sufficient to trigger this dynamic.
- Des variations quant à la longueur de séquences répétitives au sein de diverses régions codantes à boucle AT-riche du gène codant pour l’ADNr 16S mitochondrial ont été découvertes chez deux gastéropodes lors de la comparaison d’haplotypes interspécifiques. Le fait que cette variation de taille, de type discrète, impliquait la perte ou le gain de monomères de la séquence répétitive a été interprété dans un contexte phylogénétique. Il en ressort que cette variation s’apparente à une dynamique mutationnelle analogue à celle des microsatellites. Ces observations suggèrent que la présence d’une structure formée de séquences répétitives suffit, à elle seule, à enclencher ce genre de dynamique. Mots clés : microsatellites, ARNr 16S, génome mitochondrial, ADN répétitif, gastéropodes.
Author: | Markus PfenningerORCiDGND, Monika Bugert |
---|---|
URN: | urn:nbn:de:hebis:30-34966 |
DOI: | https://doi.org/10.1139/gen-44-2-163 |
Parent Title (English): | Genome |
Publisher: | NRC Research Press |
Place of publication: | Ottawa |
Document Type: | Article |
Language: | English |
Date of Publication (online): | 2006/12/07 |
Year of first Publication: | 2001 |
Publishing Institution: | Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg |
Release Date: | 2006/12/07 |
Tag: | 16S rRNA; gastropods; microsatellites; mitochondrial genome; repetitive DNA |
Volume: | 44 |
Issue: | 2 |
Page Number: | 4 |
First Page: | 1 |
Last Page: | 4 |
HeBIS-PPN: | 288829387 |
Institutes: | Biowissenschaften / Biowissenschaften |
Dewey Decimal Classification: | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 59 Tiere (Zoologie) / 590 Tiere (Zoologie) |
Sammlungen: | Sammlung Biologie / Sondersammelgebiets-Volltexte |
Licence (German): | Deutsches Urheberrecht |