Phylogeny of mangrove oomycetes

  • Taxa under scrutiny in this thesis are Halophytophthora-like oomycetes. The genus Halophytophthora, proposed in 1990, is an assemblage of unrelated species grouped together on the basis habitat preference, i.e. the mangrove or saltmarsh biome, and morphological similarity to Phytophthora. The premise “Phytophthora-like species from the mangrove environment” became the genus concept for Halophytophthora and lasted for almost 2 decades which resulted to the addition of several species (i.e. H. elongata, H. exoprolifera, H. porrigovesica, H. kandeliae, H. masteri, and H. tartarea). At the onset of molecular phylogenetics, Halophytophthora was inferred as a highly polyphyletic taxon and the genus concept was found to be unsuitable. This thesis adds to this, since six Phytophthora spp. were isolated from the mangrove environment, two of which were found in the Philippines (Phytophthora elongata and Phytophthora insolita). After a thorough assessment of the morphologic and phylogenetic data of taxa included in this thesis, several taxonomic novelties were introduced – a new family (Salispinaceae), a new genus (Calycofera), new species (Calycofera cryptica, Phytopythium dogmae, Phytopythium leanoi, Salisapilia coffeyi, and Salispina hoi), and new combinations (Calycofera operculata, Salisapilia bahamensis, S. elongata, S. epistomia, S. masteri, S. mycoparasitica). In addition, Salisapiliaceae and Salisapilia were emended.
  • Die in dieser Dissertation untersuchten Arten sind Halopyhtophthora-ähnliche Oomyceten. Die Gattung Halophythophthora, welche 1990 beschrieben wurde, ist eine Ansammlung nicht-verwandter Arten, die aufgrund ihrer Habitatpräferenzen, Mangroven- bzw. Salzmarschbiome, und morphologischer Ähnlichkeit zu Phytophthora zusammengefasst wurden. Die Prämisse „Phytophthora-ähnliche Arten aus Mangroven“ als Gattungskonzept für Halophytophthora besteht nun seit fast 2 Dekaden. Während dieser Zeit wurden eine ganze Reihe von Arten der Gattung hinzugefügt (z.B. H. elongata, H. exoprolifera, H. porrigovesica, H. kandeliae, H. masteri und H. tartarea). Mit dem Auftauchen molekularer Phylogenetik wurde jedoch klar, dass es sich bei Halophytophthora um ein höchst polyphyletisches Taxon handelt, dessen Gattungskonzept unbrauchbar war. Dieser Problematik nimmt sich diese Dissertation ausgehend von sechs Phytophthora Arten an, die aus Mangroven-Ökosystemen isoliert wurden, wovon zwei auf den Philippinen gefunden wurden (Ph. elongata und Ph. insolita). Nach detaillierter Untersuchung morphologischer und phylogenetischer Merkmale, der in dieser Thesis bearbeiteten Spezies, konnten mehrere taxonomische Neuerungen eingeführt werden – eine neue Familie (Salispinaceae), eine neue Gattung (Calycofera), fünf neue Arten (Calycofera cryptica, Phytopythium dogmae, Phytopythium leanoi, Salisapilia coffeyi und Salispina hoi) sowie einige Neukombinationen (Calycofera operculata, Salisapilia bahamensis, S. elongata, S. epistomia, S. masteri, S. mycoparasitica). Zudem wurden die Gruppen Salisapiliaceae und Salisapilia korrigiert.

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Metadaten
Author:Reuel Matignas Bennett
URN:urn:nbn:de:hebis:30:3-592450
Referee:Marco ThinesORCiDGND
Advisor:Marco Thines
Document Type:Doctoral Thesis
Language:English
Date of Publication (online):2021/04/30
Year of first Publication:2021
Publishing Institution:Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg
Granting Institution:Johann Wolfgang Goethe-Universität
Date of final exam:2021/03/24
Release Date:2021/06/15
Page Number:144
HeBIS-PPN:48029903X
Institutes:Biowissenschaften
Dewey Decimal Classification:5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie
Sammlungen:Universitätspublikationen
Sammlung Biologie / Biologische Hochschulschriften (Goethe-Universität)
Licence (German):License LogoDeutsches Urheberrecht