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Folkersen, Lasse ; Lozano-Rodríguez, Roberto ; Avendaño-Ortiz, José ; Arcos, Verónica Terrón ; Montalbán-Hernández, Karla Marina ; Quiroga, Jaime Valentín ; Pascual-Iglesias, Alejandro ; Maroun-Eid, Charbel ; Martín-Quirós, Alejandro ; Namkoong, Ho ; Okada, Yukinori ; Imoto, Seiya ; Katayama, Kazuhiko ; Fukunaga, Koichi ; Kitagawa, Yuko ; Sato, Toshiro ; Hasegawa, Naoki ; Kumanogoh, Atsushi ; Kimura, Akinori ; Ai, Masumi ; Tokunaga, Katsushi ; Kanai, Takanori ; Miyano, Satoru ; Ogawa, Seishi ; Edahiro, Ryuya ; Sonehara, Kyuto ; Shirai, Yuya ; Kanai, Masahiro ; Ishii, Makoto ; Kabata, Hiroki ; Masaki, Katsunori ; Kamata, Hirofumi ; Ikemura, Shinnosuke ; Chubachi, Shotaro ; Okamori, Satoshi ; Terai, Hideki ; Tanaka, Hiromu ; Morita, Atsuho ; Lee, Ho ; Asakura, Takanori ; Sasaki, Junichi ; Morisaki, Hiroshi ; Uwamino, Yoshifumi ; Nanki, Kosaku ; Mikami, Yohei ; Tomono, Kazunori ; Kato, Kazuto ; Matsuda, Fumihiko ; Takahashi, Meiko ; Hizawa, Nobuyuki ; Takeda, Yoshito ; Hirata, Haruhiko ; Shiroyama, Takayuki ; Miyawaki, Satoru ; Suzuki, Ken ; Maeda, Yuichi ; Nii, Takuro ; Noda, Yoshimi ; Niitsu, Takayuki ; Adachi, Yuichi ; Enomoto, Takatoshi ; Amiya, Saori ; Hara, Reina ; Takahashi, Kunihiko ; Anzai, Tatsuhiko ; Hasegawa, Takanori ; Ito, Satoshi ; Koike, Ryuji ; Endo, Akifumi ; Uchimura, Yuji ; Miyazaki, Yasunari ; Honda, Takayuki ; Tateishi, Tomoya ; Tohda, Shuji ; Ichimura, Naoya ; Sonobe, Kazunari ; Sassa, Chihiro ; Nakajima, Jun ; Nannya, Yasuhito ; Omae, Yosuke ; Takahashi, Kazuhisa ; Harada, Norihiro ; Hiki, Makoto ; Takagi, Haruhi ; Nakamura, Ai ; Tagaya, Etsuko ; Kawana, Masatoshi ; Arimura, Ken ; Ishiguro, Takashi ; Takayanagi, Noboru ; Isono, Taisuke ; Takaku, Yotaro ; Takano, Kenji ; Anan, Ryusuke ; Nakajima, Yukiko ; Nakano, Yasushi ; Nishio, Kazumi ; Ueda, Soichiro ; Hayashi, Reina ; Tateno, Hiroki ; Hase, Isano ; Yoshida, Shuichi ; Suzuki, Shoji ; Mitamura, Keiko ; Saito, Fumitake ; Ueda, Tetsuya ; Azuma, Masanori ; Nagasaki, Tadao ; Yasui, Yoshinori ; Hasegawa, Yoshinori ; Mutoh, Yoshikazu ; Yoshiyama, Takashi ; Shoko, Tomohisa ; Kojima, Mitsuaki ; Adachi, Tomohiro ; Ishikawa, Motonao ; Takahashi, Kenichiro ; Watanabe, Kazuyoshi ; Manabe, Tadashi ; Ito, Fumimaro ; Fukui, Takahiro ; Funatsu, Yohei ; Koh, Hidefumi ; Hirai, Yoshihiro ; Kawashima, Hidetoshi ; Narita, Atsuya ; Niwa, Kazuki ; Sekikawa, Yoshiyuki ; Saito, Fukuki ; Yoshiya, Kazuhisa ; Yoshihara, Tomoyuki ; Suzuki, Yusuke ; Nakayama, Sohei ; Masuzawa, Keita ; Nishi, Koichi ; Nishitsuji, Masaru ; Tani, Maiko ; Inoue, Takashi ; Hirano, Toshiyuki ; Kobayashi, Keigo ; Miyazawa, Naoki ; Kimura, Yasuhiro ; Sado, Reiko ; Ogura, Takashi ; Kitamura, Hideya ; Murohashi, Kota ; Nakachi, Ichiro ; Baba, Rie ; Arai, Daisuke ; Fuke, Satoshi ; Saito, Hiroshi ; Kuwahara, Naota ; Fujiwara, Akiko ; Okada, Takenori ; Baba, Tomoya ; Noda, Junya ; Mashimo, Shuko ; Yagi, Kazuma ; Shiomi, Tetsuya ; Hashiguchi, Mizuha ; Odani, Toshio ; Mochimaru, Takao ; Oyamada, Yoshitaka ; Mori, Nobuaki ; Izumi, Namiki ; Nagata, Kaoru ; Taki, Reiko ; Murakami, Koji ; Yamada, Mitsuhiro ; Sugiura, Hisatoshi ; Hayashi, Kentaro ; Shimizu, Tetsuo ; Gon, Yasuhiro ; Fujitani, Shigeki ; Tsuchida, Tomoya ; Yoshida, Toru ; Kagaya, Takashi ; Kita, Toshiyuki ; Sakagami, Satoru ; Kimizuka, Yoshifumi ; Kawana, Akihiko ; Nakamura, Yoshihiko ; Ishikura, Hiroyasu ; Takata, Tohru ; Kikuchi, Takahide ; Taniyama, Daisuke ; Nakamura, Morio ; Kodama, Nobuhiro ; Kaneyama, Yasunari ; Maeda, Shunsuke ; Nagasaki, Yoji ; Okamoto, Masaki ; Ishihara, Sayoko ; Ito, Akihiro ; Chihara, Yusuke ; Takeuchi, Mayumi ; Onoi, Keisuke ; Hashimoto, Naozumi ; Wakahara, Keiko ; Ando, Akira ; Masuda, Makoto ; Wakabayashi, Aya ; Watanabe, Hiroki ; Sageshima, Hisako ; Nakada, Taka-Aki ; Abe, Ryuzo ; Shimada, Tadanaga ; Kawamura, Kodai ; Ichikado, Kazuya ; Nishiyama, Kenta ; Yamasaki, Masaki ; Hashimoto, Satoru ; Kusaka, Yu ; Ohba, Takehiko ; Isogai, Susumu ; Takada, Minoru ; Kanda, Hidenori ; Komase, Yuko ; Sano, Fumiaki ; Asano, Koichiro ; Oguma, Tsuyoshi ; Harada, Masahiro ; Takahashi, Takeshi ; Shibusawa, Takayuki ; Abe, Shinji ; Kono, Yuta ; Togashi, Yuki ; Izumo, Takehiro ; Inomata, Minoru ; Awano, Nobuyasu ; Ogawa, Shinichi ; Ogata, Tomouki ; Ishihara, Shoichiro ; Kanehiro, Arihiko ; Ozaki, Shinji ; Fuchimoto, Yasuko ; Kitagawa, Yuichiro ; Yoshida, Shozo ; Ogura, Shinji ; Nishiyama, Kei ; Yoshida, Kousuke ; Beppu, Satoru ; Fukuyama, Satoru ; Eriguchi, Yoshihiro ; Yonekawa, Akiko ; Inoue, Yoshiaki ; Yamagata, Kunihiro ; Chiba, Shigeru ; Narumoto, Osamu ; Nagai, Hideaki ; Ooshima, Nobuharu ; Motegi, Mitsuru ; Sagara, Hironori ; Tanaka, Akihiko ; Ohta, Shin ; Shibata, Yoko ; Tanino, Yoshinori ; Sato, Yuki ; Yamada, Yuichiro ; Hashino, Takuya ; Shinoki, Masato ; Iwagoe, Hajime ; Imamura, Tomonori ; Umeda, Akira ; Shimada, Hisato ; Endo, Mayu ; Hayashi, Shinichi ; Takahashi, Mai ; Nakano, Shigefumi ; Yatomi, Masakiyo ; Maeno, Toshitaka ; Ishii, Tomoo ; Utsugi, Mitsuyoshi ; Ono, Akihiro ; Kanaoka, Kensuke ; Ihara, Shoichi ; Komuta, Kiyoshi ; Franke, Lude ; Boezen, Marike ; Claringbould, Annique ; Lopera, Esteban ; Warmerdam, Robert ; Vonk, Judith. M. ; van Blokland, Irene ; Lanting, Pauline ; Ori, Anil P. S. ; Obeidat, Ma’en ; Hernández Cordero, Ana I. ; Sin, Don D. ; Bossé, Yohan ; Joubert, Philippe ; Hao, Ke ; Nickle, David ; Timens, Wim ; van den Berge, Maarten ; Feng, Yen-Chen Anne ; Mercader, Josep ; Weiss, Scott T. ; Karlson, Elizabeth W. ; Smoller, Jordan ; Murphy, Shawn N. ; Meigs, James B. ; Woolley, Ann E. ; Green, Robert C. ; Perez, Emma F. ; Wolford, Brooke ; Zöllner, Sebastian ; Wang, Jiongming ; Beck, Andrew ; Sloofman, Laura G. ; Ascolillo, Steven ; Sebra, Robert P. ; Collins, Brett L. ; Levy, Tess ; Sealfon, Stuart C. ; Jordan, Daniel M. ; Thompson, Ryan C. ; Gettler, Kyle ; Chaudhary, Kumardeep ; Belbin, Gillian M. ; Preuss, Michael ; Hoggart, Clive ; Choi, Sam ; Underwood, Slayton J. ; Salib, Irene ; Britvan, Bari ; Keller, Katherine ; Tang, Lara ; Peruggia, Michael ; Hiester, Liam L. ; Niblo, Kristi ; Aksentijevich, Alexandra ; Labkowsky, Alexander ; Karp, Avrohom ; Zlatopolsky, Menachem ; Zyndorf, Marissa ; Charney, Alexander W. ; Beckmann, Noam D. ; Schadt, Eric E. ; Abul-Husn, Noura S. ; Cho, Judy H. ; Itan, Yuval ; Kenny, Eimear E. ; Loos, Ruth J. F. ; Nadkarni, Girish N. ; Do, Ron ; O’Reilly, Paul ; Huckins, Laura M. ; Ferreira, Manuel A. R. ; Abecasis, Goncalo R. ; Leader, Joseph B. ; Cantor, Michael N. ; Justice, Anne E. ; Carey, Dave J. ; Chittoor, Geetha ; Josyula, Navya Shilpa ; Kosmicki, Jack A. ; Horowitz, Julie E. ; Baras, Aris ; Gass, Matthew C. ; Yadav, Ashish ; Mirshahi, Tooraj ; Jan Hottenga, Jouke ; Bartels, Meike ; de Geus, Eco J. C. ; Nivard, Michel G. ; Verma, Anurag ; Ritchie, Marylyn D. ; Rader, Daniel ; Li, Binglan ; Verma, Shefali S. ; Lucas, Anastasia ; Bradford, Yuki ; Zara, Federico ; Salpietro, Vincenzo ; Scala, Marcello ; Iacomino, Michele ; Scudieri, Paolo ; Bocciardi, Renata ; Minetti, Carlo ; Riva, Antonella ; Vari, Maria Stella ; Rahier, Jean-François ; Giorgio, Elisa ; Carli, Diana ; Louis, Edouad ; Bulik, Cynthia M. ; Landén, Mikael ; Brusco, Alfredo ; Ferrero, Giovanni Battista ; Madia, Francesca ; Fundín, Bengt ; Ismail, Said I. ; Saad, Chadi ; Al-Sarraj, Yaser ; Badji, Radja Messai ; Al-Muftah, Wadha ; Al Thani, Asma ; Afifi, Nahla ; Klovins, Janis ; Rovite, Vita ; Rescenko, Raimonds ; Peculis, Raitis ; Ustinova, Monta ; Zeberg, Hugo ; Frithiof, Robert ; Hultström, Michael ; Lipcsey, Miklos ; Johnson, Ruth ; Geschwind, Daniel H. ; Freimer, Nelson B. ; Butte, Manish J. ; Geschwind, Daniel H. ; Pasaniuc, Bogdan ; Ding, Yi ; Chiu, Alec ; Chang, Timothy S. ; Boutros, Paul ; Moutsianas, Loukas ; Caulfield, Mark J. ; Scott, Richard H. ; Walker, Susan ; Stuckey, Alex ; Odhams, Christopher A. ; Rhodes, Daniel ; Fowler, Tom ; Rendon, Augusto ; Chan, Georgia ; Arumugam, Prabhu ; Karczewski, Konrad J. ; Wilson, Daniel J. ; Spencer, Chris A. ; Crook, Derrick W. ; Wyllie, David H. ; O’Connell, Anne Marie ; Atkinson, Elizabeth G. ; Kanai, Masahiro ; Tsuo, Kristin ; Baya, Nikolas ; Turley, Patrick ; Gupta, Rahul ; Walters, Raymond K. ; Palmer, Duncan S. ; Sarma, Gopal ; Solomonson, Matthew ; Cheng, Nathan ; Lu, Wenhan ; Churchhouse, Claire ; Goldstein, Jacqueline I. ; King, Daniel ; Seed, Cotton ; Daly, Mark J. ; Neale, Benjamin M. ; Bryant, Sam ; Satterstrom, F. Kyle ; Band, Gavin ; Earle, Sarah G. ; Lin, Shang-Kuan ; Arning, Nicolas ; Armstrong, Jacob ; Rudkin, Justine K. ; Callier, Shawneequa ; Bryant, Sam ; Cusick, Caroline ; Soranzo, Nicole ; Zhao, Jing Hua ; Danesh, John ; Di Angelantonio, Emanuele ; Butterworth, Adam S. ; Sun, Yan V. ; Huffman, Jennifer E. ; Cho, Kelly ; O’Donnell, Christopher J. ; Tsao, Phil ; Gaziano, J. Michael ; Peloso, Gina ; Ho, Yuk-Lam ; Mian, Michael ; Scaggiante, Federica ; Chang, Xiao ; Glessner, Joseph R. ; Hakonarson, Hakon ; McGuigan, Peter J. ; Prockter Moore, Luke Stephen ; Vizcaychipi, Marcela Paola ; Hall, Kathryn ; Campbell, Andy ; Nichol, Ailstair ; Ward, Geraldine ; Page, Valerie Joan ; Semple, Malcolm G. ; Adeniji, Kayode ; Agranoff, Daniel ; Agwuh, Ken ; Ail, Dhiraj ; Aldera, Erin L. ; Alegria, Ana ; Angus, Brian ; Ashish, Abdul ; Atkinson, Dougal ; Bari, Shahedal ; Barlow, Gavin ; Barnass, Stella ; Barrett, Nicholas ; Bassford, Christopher ; Basude, Sneha ; Baxter, David ; Beadsworth, Michael ; Bernatoniene, Jolanta ; Berridge, John ; Best, Nicola ; Bothma, Pieter ; Chadwick, David ; Brittain-Long, Robin ; Bulteel, Naomi ; Burden, Tom ; Burtenshaw, Andrew ; Caruth, Vikki ; Chambler, Duncan ; Chee, Nigel ; Child, Jenny ; Chukkambotla, Srikanth ; Clark, Tom ; Collini, Paul ; Cosgrove, Catherine ; Cupitt, Jason ; Cutino-Moguel, Maria-Teresa ; Dark, Paul ; Dawson, Chris ; Dervisevic, Samir ; Donnison, Phil ; Douthwaite, Sam ; Drummond, Andrew ; DuRand, Ingrid ; Dushianthan, Ahilanadan ; Dyer, Tristan ; Evans, Cariad ; Eziefula, Chi ; Fegan, Christopher ; Finn, Adam ; Fullerton, Duncan ; Garg, Sanjeev ; Garg, Atul ; Gkrania-Klotsas, Effrossyni ; Godden, Jo ; Goldsmith, Arthur ; Graham, Clive ; Hardy, Elaine ; Hartshorn, Stuart ; Harvey, Daniel ; Havalda, Peter ; Hawcutt, Daniel B. ; Hobrok, Maria ; Hodgson, Luke ; Hormis, Anil ; Jacobs, Michael ; Jain, Susan ; Jennings, Paul ; Kaliappan, Agilan ; Kasipandian, Vidya ; Kegg, Stephen ; Kelsey, Michael ; Kendall, Jason ; Kerrison, Caroline ; Kerslake, Ian ; Koch, Oliver ; Koduri, Gouri ; Koshy, George ; Laha, Shondipon ; Laird, Steven
The genetic make-up of an individual contributes to the susceptibility and response to viral infection. Although environmental, clinical and social factors have a role in the chance of exposure to SARS-CoV-2 and the severity of COVID-191,2, host genetics may also be important. Identifying host-specific genetic factors may reveal biological mechanisms of therapeutic relevance and clarify causal relationships of modifiable environmental risk factors for SARS-CoV-2 infection and outcomes. We formed a global network of researchers to investigate the role of human genetics in SARS-CoV-2 infection and COVID-19 severity. Here we describe the results of three genome-wide association meta-analyses that consist of up to 49,562 patients with COVID-19 from 46 studies across 19 countries. We report 13 genome-wide significant loci that are associated with SARS-CoV-2 infection or severe manifestations of COVID-19. Several of these loci correspond to previously documented associations to lung or autoimmune and inflammatory diseases3,4,5,6,7. They also represent potentially actionable mechanisms in response to infection. Mendelian randomization analyses support a causal role for smoking and body-mass index for severe COVID-19 although not for type II diabetes. The identification of novel host genetic factors associated with COVID-19 was made possible by the community of human genetics researchers coming together to prioritize the sharing of data, results, resources and analytical frameworks. This working model of international collaboration underscores what is possible for future genetic discoveries in emerging pandemics, or indeed for any complex human disease.
The resprouting response of plant species to fire is a key life history trait that has profound effects on post-fire population dynamics and community composition. This study documents the post-fire response (resprouting and maturation times) of woody species in six contrasting formations in the New England Tableland Bioregion of eastern Australia. Rainforest had the highest proportion of resprouting woody taxa and rocky outcrops had the lowest. Surprisingly, no significant difference in the median maturation length was found among habitats, but the communities varied in the range of maturation times. Within these communities, seedlings of species killed by fire, mature faster than seedlings of species that resprout. The slowest maturing species were those that have canopy held seed banks and were killed by fire, and these were used as indicator species to examine fire immaturity risk. Finally, we examine whether current fire management immaturity thresholds appear to be appropriate for these communities and find they need to be amended.
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