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Daphnien sind ein wichtiger Bestandteil des Süßwasserzooplanktons und in einer Vielzahl von biologischen Disziplinen als Modellorganismus etabliert. Ihr zyklisch parthenogenetischer Lebenszyklus und die hohen Raten von interspezischer Hybridisierung mancher Artkomplexe machen sie zu einem interessanten Forschungsobjekt. Die vorliegende Arbeit bietet Einblicke in die Populationsstruktur einer dieser Komplexe, des D. longispina-Artkomplexes, und testete ein neu entwickeltes Markersystem bei diesen Tieren auf gesamteuropäischer Ebene (33 Sammelorte, 1155 Individuen). Es wurden dazu molekulare Analysetechniken mit zwölf polymorphen Mikrosatelliten-Markern mit etablierten ITS-RFLP-Analysen verglichen.
Durch statistische Auswertemethoden mit den Programmen NewHybrids und Structure konnten Elternarten gut zugeordnet werden. Die Betrachtung der Kullback-Leibler Divergenzen in den Analysen durch NewHybrids deuten sogar darauf hin, dass die Anzahl der Mikrosatellitenmarker auf wenige besoders informative Loci reduziert werden kann, was bei Fragestellungen zur Art- und Hybrididentifizierung Zeit und Kosten spart. Ein Protokoll zur Vorgehensweise bei der Art- und Hybrididentifizierung wurde entwickelt.
Die Arten und Populationen selbst waren hoch differenziert. Zwischen den drei untersuchten Arten wurde ein FST von 0,29 gefunden. Ergebnisse aus einer AMOVA zeigten sogar, dass die Differenzierung zwischen den Populationen innerhalb der Arten leicht über dieser interspezifischen Differenzierung liegt (D galeata 0,40; D. longispina 0,52 und D. cucullata 0,42). Da auch keine isolation by distance gefunden wurde, lassen die Ergebnisse meiner Analysen auf „Provinzialismus“ schließen – ein Konzept, das genau dieses Muster voraussagt. Erklärt wird dieser Provinzialismus durch die Monopolisierungshypothese. Die Beobachtung, dass in der Regel in den untersuchten Populationen ein Heterozygotendefizit vorliegt, obwohl klonale Vermehrung oft zu einem Heterozygotenüberschuss führt (Meselson-Effekt), zeigt häufig vorkommende sexuelle Vermehrung an. Das Heterozygotendefizit deutet ebenfalls auf einen Wahlund-Effekt hin.
Es wurde weiterhin getestet, ob das Vorkommen von introgressiver, interspezifischer Hybridisierung in bestimmten Lokalitäten im Vergleich mit Lokalitäten, in denen ein Taxon allopatrisch lebt, einen Einfluss auf die Populationsstruktur hat. Die klonale Diversität sowie die beobachtete Heterozygotie standen dabei im Mittelpunkt der Analysen. Es wurde kein statistisch signifikanter Einfluss der Hybridisierung auf die Diversität gefunden.
In dieser Arbeit werden erstmals Mutationsraten von Mikrosatelliten von Daphnia-Taxa aus der Klasse der Crustaceen vorgestellt. Es wurden zwölf Loci bei 27 Individuen über einen Zeitraum von 240 Generationen getestet, von denen 267 Klon/Locus-Kombinationen informativ waren und in denen an drei solcher Kombinationen Mutation beobachtet wurde. Gemittelt über alle Taxa und Loci wurde eine Rate von 2,34 * 10-5 Mutationen pro Allel und Generation gefunden. Der Vergleich mit Mutationsraten anderer Organismen zeigt, dass die gefundene Rate durchaus in deren Größenordnung liegt. Am nächsten kommen sie den Raten, die bei Schweinen und Fruchtfliegen gefunden wurden.
The comeback of the Eurasian beaver (Castor fiber) throughout western and central Europe is considered a major conservation success. Traditionally, several subspecies are recognised by morphology and mitochondrial haplotype, each linked to a relict population. During various reintroduction programs in the 20th century, beavers from multiple source localities were released and now form viable populations. These programs differed in their reintroduction strategies, i.e., using pure subspecies vs. mixed source populations. This inhomogeneity in management actions generated ongoing debates regarding the origin of present beaver populations and appropriate management plans for the future. By sequencing of the mitochondrial control region and microsatellite genotyping of 235 beaver individuals from five selected regions in Germany, Switzerland, Luxembourg, and Belgium we show that beavers from at least four source origins currently form admixed, genetically diverse populations that spread across the study region. While regional occurrences of invasive North American beavers (n = 20) were found, all but one C. fiber bore the mitochondrial haplotype of the autochthonous western Evolutionary Significant Unit (ESU). Considering this, as well as the viability of admixed populations and the fact that the fusion of different lineages is already progressing in all studied regions, we argue that admixture between different beaver source populations should be generally accepted.
Large-scale genetic census of an elusive carnivore, the European wildcat (Felis s. silvestris)
(2016)
The European wildcat, Felis silvestris silvestris, serves as a prominent target species for the reconnection of central European forest habitats. Monitoring of this species, however, appears difficult due to its elusive behaviour and the ease of confusion with domestic cats. Recently, evidence for multiple wildcat occurrences outside its known distribution has accumulated in several areas across Central Europe, questioning the validity of available distribution data for this species. Our aim was to assess the fine-scale distribution and genetic status of the wildcat in its central European distribution range. We compiled and analysed genetic samples from roadkills and hundreds of recent hair-trapping surveys and applied phylogenetic and genetic clustering methods to discriminate wild and domestic cats and identify population subdivision. 2220 individuals were confirmed as either wildcat (n = 1792) or domestic cat (n = 342), and the remaining 86 (3.9 %) were identified as hybrids between the two. Remarkably, genetic distinction of domestic cats, wildcats and their hybrids was only possible when taking into account the presence of two highly distinct genetic lineages of wildcats, with a suture zone in central Germany. 44 % of the individual wildcats where sampled outside the previously published distribution. Our analyses confirm a relatively continuous spatial presence of wildcats across large parts of the study area in contrast to previous analyses indicating a highly fragmented distribution. Our results suggest that wildcat conservation and management should take advantage of the higher than previously assumed dispersal potential of wildcats, which may use wildlife corridors very efficiently.