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Se analizan las relaciones filogenéticas de las especies de Anomodon y sus géneros más afines, Haplohymenium y Herpetineuron. Anomodon está restringido al hemisferio norte: hay cuatro especies en México (algunas de las cuales llegan a Guatemala y/o las islas del Caribe), dos en Estados Unidos y Canadá, una en Europa y el resto en el sur y este asiáticos. Se incluyen tres especies de Haplohymenium, Herpetineuron toccoae, H. acutifolium (=Anomodon acutifolius, Granzow-de la Cerda 1989) y Pterogonium gracile. Los 31 caracteres para los 17 taxa se analizaron con el programa PAUP, versión 3.0, para Macintosh (Swofford 1991). De acuerdo con los árboles resultantes, las 11 especies de Anomodon son monofiléticas, siempre que dicho taxon incluya las especies de Haplohymenium. Anomodon comprende dos clados, uno que coincide con el subgénero Pseudoanomodon constituido por A. longifolius, A. attenuatus, A. giraldii y A. rostratus; el otro coincide con el subgénero Anomodon el cual incluye las especies de Haplohymenium. Se propone la reducción de este último a la categoría de sección Haplohymenium.