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Due to globally rising numbers of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infections, resources for real-time reverse-transcription polymerase chain reaction (rRT-PCR)-based testing have been exhausted. In order to meet the demands of testing and reduce transmission, SARS-CoV-2 antigen-detecting rapid diagnostic tests (Ag-RDTs) are being considered. These tests are fast, inexpensive, and simple to use, but whether they detect potentially infectious cases has not been well studied. We evaluated three lateral flow assays (RIDA®QUICK SARS-CoV-2 Antigen (R-Biopharm), SARS-CoV-2 Rapid Antigen Test (Roche)), and NADAL® COVID-19 Ag Test (Nal von Minden GmbH, Regensburg, Germany) and one microfluidic immunofluorescence assay (SARS-CoV-2 Ag Test (LumiraDx GmbH, Cologne, Germany)) using 100 clinical samples. Diagnostic rRT-PCR and cell culture testing as a marker for infectivity were performed in parallel. The overall Ag-RDT sensitivity for rRT-PCR-positive samples ranged from 24.3% to 50%. However, for samples with a viral load of more than 6 log10 RNA copies/mL (22/100), typically seen in infectious individuals, Ag-RDT positivity was between 81.8% and 100%. Only 51.6% (33/64) of the rRT-PCR-positive samples were infectious in cell culture. In contrast, three Ag-RDTs demonstrated a more significant correlation with cell culture infectivity (61.8–82.4%). Our findings suggest that large-scale SARS-CoV-2 Ag-RDT-based testing can be considered for detecting potentially infective individuals and reducing the virus spread.
Background: International travel is a major driver of the introduction and spread of SARS- CoV-2. Aim: To investigate SARS-CoV-2 genetic diversity in the region of a major transport hub in Germany, we characterized the viral sequence diversity of the SARS-CoV-2 variants circulating in Frankfurt am Main, the city with the largest airport in Germany, from the end of October to the end of December 2020. Methods: In total, we recovered 136 SARS-CoV-2 genomes from nasopharyngeal swab samples. We isolated 104 isolates that were grown in cell culture and RNA from the recovered viruses and subjected them to full-genome sequence analysis. In addition, 32 nasopharyngeal swab samples were directly sequenced. Results and conclusion: We found 28 different lineages of SARS- CoV-2 circulating during the study period, including the variant of concern B.1.1.7 (∆69/70, N501Y). Six of the lineages had not previously been observed in Germany. We detected the spike protein (S) deletion ∆69/∆70 in 15% of all sequences, a four base pair (bp) deletion (in 2.9% of sequences) and a single bp deletion (in 0.7% of sequences) in ORF3a, leading to ORF3a truncations. In four sequences (2.9%), an amino acid deletion at position 210 in S was identified. In a single sample (0.7%), both a 9 bp deletion in ORF1ab and a 7 bp deletion in ORF7a were identified. One sequence in lineage B.1.1.70 had an N501Y substitution while lacking the ∆69/70 in S. The high diversity of sequences observed over two months in Frankfurt am Main highlights the persisting need for continuous SARS-CoV-2 surveillance using full-genome sequencing, particularly in cities with international airport connections.
Aus der Notwendigkeit heraus, "nachhaltig die Funktionen des Bodens zu sichern" (§1 BBodSchG), und damit auch Bodenschutz vorsorgend in Planungsprozesse zu integrieren, wurde ein neues Bodenschutzkonzept entwickelt. Es basiert auf einer differenzierten, aber gleichzeitig nachvollziehbaren Bodenbewertung. Das Problem bei der Bodenbewertung ist, dass etwas bewertet werden soll, für das - je nach Fragestellung - immer wieder neue Ziele definiert werden müssen. Deshalb liegt der Bodenbewertung ein Zielsystem zu Grunde, das Schutzziele klar festlegt und mit Hilfe dessen die Bodenbewertung nachvollziehbar wird. Für das Bodenschutzkonzept werden aus der Vielzahl möglicher Kriterien wichtige vorgestellt, aus denen die - bezogen auf dieses Zielsystem - wesentlichen ausgewählt werden können. Um aussagekräftige Daten für diese Kriterien zu erhalten stützt sich die Bodenbewertung auf bodenkundliche sowie landschaftsgenetisch-geomorphologische Zusammenhänge. Die eigentliche Bewertung erfolgt dann in drei Schritten: zuerst eine Einzelbewertung, dann zusammengefasst nach den Bodenfunktionen Lebensraumfunktion, Regelungsfunktion, Informationsfunktion, dem Eigenwert des Bodens (Schutzwürdigkeit) sowie der Empfindlichkeit und Gefährdung (Schutzbedürftigkeit). Im dritten Schritt werden diese Bewertungen dann zu einer gewichteten, verbal-argumentativen Gesamtbewertung der Schutzwürdigkeit und Schutzbedürftigkeit zusammengefasst. Mit Hilfe des Bewertungsverfahrens werden auch Zielkonflikte zwischen den unterschiedlichen Schutzgütern offengelegt. Schutzmaßnahmen ergeben sich dann stringent aus den vorher im Zielsystem gesetzten Prämissen, d.h., Ziele und Maßnahmen sind begründbar gewählt, stehen in einem ökologischen Gesamtzusammenhang und lassen sich sehr gut nachvollziehen. Das hier vorgestellte, neue Bodenschutzkonzept ist für verschiedene Planungsebenen geeignet. Es ist in unterschiedlichen Naturräumen anwendbar, kann verschiedene Schutzziele mit Hilfe des Zielsystems bestimmen und so z.B. die Naturraumvielfalt in einem Gebiet ebenso berücksichtigen wie die Meinungsvielfalt, was unter vorsorgendem Bodenschutz zu verstehen sei.