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Identification of eph receptor signaling as a regulator of autophagy and a therapeutic target in colorectal carcinoma (2019)
DiPrima, Michael ; Wang, Dunrui ; Tröster, Tröster, Alix ; Maric, Dragan ; Terrades-Garcia, Nekane ; Ha, Taekyu ; Kwak, Hyeongil ; Sánchez-Martín, David ; Kudlinzki, Denis ; Schwalbe, Harald ; Tosato, Giovanna
Advanced colorectal carcinoma is currently incurable, and new therapies are urgently needed. We report that phosphotyrosine-dependent Eph receptor signaling sustains colorectal carcinoma cell survival, thereby uncovering a survival pathway active in colorectal carcinoma cells. We find that genetic and biochemical inhibition of Eph tyrosine kinase activity or depletion of the Eph ligand EphrinB2 reproducibly induces colorectal carcinoma cell death by autophagy. Spautin and 3-methyladenine, inhibitors of early steps in the autophagic pathway, significantly reduce autophagy-mediated cell death that follows inhibition of phosphotyrosine-dependent Eph signaling in colorectal cancer cells. A small-molecule inhibitor of the Eph kinase, NVP-BHG712 or its regioisomer NVP-Iso, reduces human colorectal cancer cell growth in vitro and tumor growth in mice. Colorectal cancers express the EphrinB ligand and its Eph receptors at significantly higher levels than numerous other cancer types, supporting Eph signaling inhibition as a potential new strategy for the broad treatment of colorectal carcinoma.
High-resolution cryo-EM structures of respiratory complex I: Mechanism, assembly, and disease (2019)
Parey, Kristian Kurt ; Haapanen, Outi ; Sharma, Vivek ; Köfeler, Harald ; Züllig, Thomas ; Prinz, Simone ; Siegmund, Karin ; Wittig, Ilka ; Mills, Deryck J. ; Vonck, Janet ; Kühlbrandt, Werner ; Zickermann, Volker
Respiratory complex I is a redox-driven proton pump, accounting for a large part of the electrochemical gradient that powers mitochondrial adenosine triphosphate synthesis. Complex I dysfunction is associated with severe human diseases. Assembly of the one-megadalton complex I in the inner mitochondrial membrane requires assembly factors and chaperones. We have determined the structure of complex I from the aerobic yeast Yarrowia lipolytica by electron cryo-microscopy at 3.2-Å resolution. A ubiquinone molecule was identified in the access path to the active site. The electron cryo-microscopy structure indicated an unusual lipid-protein arrangement at the junction of membrane and matrix arms that was confirmed by molecular simulations. The structure of a complex I mutant and an assembly intermediate provide detailed molecular insights into the cause of a hereditary complex I-linked disease and complex I assembly in the inner mitochondrial membrane.
Data file of a deep proteome analysis of the prefrontal cortex in aged mice with progranulin deficiency or neuronal overexpression of progranulin (2016)
Heidler, Juliana ; Hardt, Stefanie ; Wittig, Ilka ; Tegeder, Irmgard
Progranulin deficiency is associated with neurodegeneration in humans and in mice. The mechanisms likely involve progranulin-promoted removal of protein waste via autophagy. We performed a deep proteomic screen of the pre-frontal cortex in aged (13–15 months) female progranulin-deficient mice (GRN−/−) and mice with inducible neuron-specific overexpression of progranulin (SLICK-GRN-OE) versus the respective control mice. Proteins were extracted and analyzed per liquid chromatography/mass spectrometry (LC/MS) on a Thermo Scientific™ Q Exactive Plus equipped with an ultra-high performance liquid chromatography unit and a Nanospray Flex Ion-Source. Full Scan MS-data were acquired using Xcalibur and raw files were analyzed using the proteomics software Max Quant. The mouse reference proteome set from uniprot (June 2015) was used to identify peptides and proteins. The DiB data file is a reduced MaxQuant output and includes peptide and protein identification, accession numbers, protein and gene names, sequence coverage and label free quantification (LFQ) values of each sample. Differences in protein expression in genotypes are presented in "Progranulin overexpression in sensory neurons attenuates neuropathic pain in mice: Role of autophagy" (C. Altmann, S. Hardt, C. Fischer, J. Heidler, H.Y. Lim, A. Haussler, B. Albuquerque, B. Zimmer, C. Moser, C. Behrends, F. Koentgen, I. Wittig, M.H. Schmidt, A.M. Clement, T. Deller, I. Tegeder, 2016) [1].
Reprint of: Decorin activates AMPK, an energy sensor kinase, to induce autophagy in endothelial cells (2014)
Goyal, Atul ; Neill, Thomas ; Owens, Rick T. ; Schäfer, Liliana ; Iozzo, Renato V.
The highly conserved eukaryotic process of macroautophagy (autophagy) is a non-specific bulk-degradation program critical for maintaining proper cellular homeostasis, and for clearing aged and damaged organelles. This decision is inextricably dependent upon prevailing metabolic demands and energy requirements of the cell. Soluble monomeric decorin functions as a natural tumor repressor that antagonizes a variety of receptor tyrosine kinases. Recently, we discovered that decorin induces endothelial cell autophagy, downstream of VEGFR2. This process was wholly dependent upon Peg3, a decorin-inducible genomically imprinted tumor suppressor gene. However, the signaling cascades responsible have remained elusive. In this report we discovered that Vps34, a class III phosphoinositide kinase, is an upstream kinase required for Peg3 induction. Moreover, decorin triggered differential formation of Vps34/Beclin 1 complexes with concomitant dissolution of inhibitive Bcl-2/Beclin 1 complexes. Further, decorin inhibited anti-autophagic signaling via suppression of Akt/mTOR/p70S6K activity with the concurrent activation of pro-autophagic AMPK-mediated signaling cascades. Mechanistically, AMPK is downstream of VEGFR2 and inhibition of AMPK signaling abrogated decorin-evoked autophagy. Collectively, these findings hint at the complexity of the underlying molecular relays necessary for decorin-evoked endothelial cell autophagy and reveal important therapeutic targets for augmenting autophagy and combatting tumor angiogenesis.
Decorin activates AMPK, an energy sensor kinase, to induce autophagy in endothelial cells (2014)
Goyal, Atul ; Neill, Thomas ; Owens, Rick T. ; Schäfer, Liliana ; Iozzo, Renato V.
The highly conserved eukaryotic process of macroautophagy (autophagy) is a non-specific bulk-degradation program critical for maintaining proper cellular homeostasis, and for clearing aged and damaged organelles. This decision is inextricably dependent upon prevailing metabolic demands and energy requirements of the cell. Soluble monomeric decorin functions as a natural tumor repressor that antagonizes a variety of receptor tyrosine kinases. Recently, we discovered that decorin induces endothelial cell autophagy, downstream of VEGFR2. This process was wholly dependent upon Peg3, a decorin-inducible genomically imprinted tumor suppressor gene. However, the signaling cascades responsible have remained elusive. In this report we discovered that Vps34, a class III phosphoinositide kinase, is an upstream kinase required for Peg3 induction. Moreover, decorin triggered differential formation of Vps34/Beclin 1 complexes with concomitant dissolution of inhibitive Bcl-2/Beclin 1 complexes. Further, decorin inhibited anti-autophagic signaling via suppression of Akt/mTOR/p70S6K activity with the concurrent activation of pro-autophagic AMPK-mediated signaling cascades. Mechanistically, AMPK is downstream of VEGFR2 and inhibition of AMPK signaling abrogated decorin-evoked autophagy. Collectively, these findings hint at the complexity of the underlying molecular relays necessary for decorin-evoked endothelial cell autophagy and reveal important therapeutic targets for augmenting autophagy and combatting tumor angiogenesis.
Justice deficit or justice deficient? (2015)
Isiksel, Turkuler
The richest compilation to date of essays in the political theory of European integration has just landed with a thud, and is bound to reverberate for some time in the sleek corridors of Brussels and the wood-paneled seminar rooms of Bruges. Edited by Kochenov, de Búrca, and Williams, Europe’s Justice Deficit? is more than an attempt to initiate a discussion about the questions of justice prompted by European integration. With thirty contributions by leading scholars of law, history, political science and philosophy, not much worth noting on this seemingly boundless subject is left unsaid. ...
[Rezension zu:] Christiane NOWAK – Lorenz WINKLER-HORAČEK (Hgg.), Auf der Suche nach der Wirklichkeit. Realismen in der griechischen Plastik. Begleitbuch zu einer Ausstellung der Abguss-Sammlung Antiker Plastik des Instituts für Klassische Archäologie der Freien Universität Berlin. Rahden/Westf.: Verlag Marie Leidorf 2018, 264 S., 100 Abb. (2018)
Raeck, Wulf
Der hier zu besprechende Sammelband ist das Begleitbuch zu einer Ausstellung der Abguss-Sammlung des Instituts für Klassische Archäologie der Freien Universität Berlin zum Thema "Realismen in der griechischen Plastik", die von Februar bis Juli 2018 dort zu sehen war. Die Ausstellung war aus Lehrveranstaltungen der beiden Herausgeber hervorgegangen und folgte damit bekannten Vorgängern vergangener Jahrzehnte, deren begleitende Kataloge geradezu Handbuchstatus erlangt haben. ...
[Rezension zu:] Markus SCHOLZ, Grabbauten des 1.-3. Jahrhunderts in den nördlichen Grenzprovinzen des Römischen Reiches. Monographien des RGZM Mainz Bd. 103. Regensburg: Schnell & Steiner 2013, 1140 S., 396 s/w Illustrationen, 21 farb. Illustrationen, 2 Bände, 22 farb. Karten (2015)
Töpfer, Kai
Römische Grabbauten sind im Grunde kein Thema, dem es an wissenschaftlicher Aufmerksamkeit mangelt. Allerdings lag der Fokus in den vergangenen Jahrzehnten beinahe durchweg auf den Denkmälern in Rom und Italien, die sowohl aus bautypologischer als auch aus sozial- und kulturhistorischer Perspektive intensiv erforscht wurden und werden. Für die Grabbauten in den Provinzen, insbesondere den Nordwestprovinzen fehlte es dagegen lange an übergreifenden Studien. Diese Lücke wird nun durch die in Teilen auf den Ergebnissen eines EUProjektes zum Thema "Transformation" aufbauende Studie von Markus Scholz (S.) geschlossen, der sich den erhaltenen Denkmälern in detaillierter Weise anhand einer typologischen Methodik annimmt. Der Größe des Untersuchungsgebiets, das von Britannien über die Rhein- und Donauprovinzen bis ans Schwarze Meer reicht, und der damit einhergehend immensen Zahl einbezogener Objekte (ca. 3500 Grabbauten) entspricht auch der Umfang des Werkes, das mit zwei Bänden mit jeweils rund 570 Seiten bereits auf den ersten Blick gewichtig anmutet. ...
[Rezension zu:] Bernd STEIDL, Welterbe Limes. Roms Grenze am Main. Mit Beiträgen von Ludwig Wamser und Horst Zimmerhackl. Ausstellungskataloge der Archäologischen Staatssammlung Bd. 36. Obernburg am Main: Logo Verlag Erfurth 2008, 300 S., 280 meist farbige Abb., 1 Kartenbeilage (2010)
Scholz, Markus
Das vorliegende Buch ist als Begleitband zur gleichnamigen Sonderausstellung erschienen, die vom 04.04.-14.09.2008 in der Archäologischen Staatssammlung München gezeigt wurde. Sein Titel weckt hohe Erwartungen, verspricht er doch die Betrachtung einer kurzen, in der oberflächlichen Gesamtwahrnehmung der römischen Militärgrenzen an Rhein und Donau kaum auffälligen Teilstrecke des obergermanischen Limes als Beispiel eines kulturellen Welterbes. Es handelt sich um die rund 50 km lange Strecke der militärisch gesicherten Außengrenze der römischen Provinz Germania Superior, die zwischen dem bei Hanau gelegenen Großkrotzenburg und Miltenberg entlang des westlichen Ufers des Mains verlief. Dieser Limesabschnitt unterscheidet sich einzig dadurch von allen anderen Strecken des obergermanischen Limes, dass die durchgehenden Grenzsperren nicht aus Palisaden bzw. (später) Wall und Graben bestanden, sondern der Fluss selbst die natürliche Grenzsperre zwischen dem römischen Provinzterritorium und den germanischen Stammesgebieten bildete. ...
[Rezension zu:] Dietrich BOSCHUNG (Hrsg.), Grabbauten des 2. und 3. Jahrhunderts in den gallischen und germanischen Provinzen. Akten des Internationalen Kolloquiums Köln 22. bis 23. Februar 2007. Schriften des Lehr- und Forschungszentrums für die antiken Kulturen des Mittelmeerraumes – Centre for Mediterranean Cultures. ZAKMIRA Bd. 7. Wiesbaden: Reichert Verlag 2009, 332 S., 123 s/w-Abb. (2010)
Linnemann, Johannes Christian
Der vorliegende Band umfasst vier Themenkomplexe, die in insgesamt elf Aufsätzen behandelt werden. Während sich das erste Kapitel ausschließlich auf eine in der Vulkaneifel (in Duppach-Weiermühle) gelegene Nekropole mit ihren Grabmäler beschränkt, die wie aus dem Vorwort ersichtlich den eigentlichen Anlass und Schwerpunkt des Kolloquiums darstellt, wird der Fokus im zweiten Kapitel auf diverse Grabbauten im Saarland und in Rheinland-Pfalz erweitert. Im dritten Abschnitt werden exemplarisch einige ausgewählte Grabbezirke und Grabbauten aus dem Rheinland, Kärnten und dem Schweizer Jura vorgestellt, bevor im letzten Kapitel unter dem Gesichtspunkt "Struktur und Nutzung" sowohl Grabbauten in Villenkontexten auf der Iberischen Halbinsel gezeigt werden als auch in einem kurzen Aufsatz der Umgang mit römischen Grabbauten in Spätantike und Mittelalter angesprochen wird. ... Während sich Peter Henrich im ersten Artikel (S. 13-37) auf die Topographie und den Grabungsbefund konzentriert, um gegen Ende noch einen kurzen Ausblick auf die chronologische Entwicklung, die Umnutzung sowie die darauffolgende Zerstörung zu bieten, unternimmt Marianne Tabaczek daraufhin (S. 39-65) den Versuch, die beiden stark zerstörten Grabmäler A und B zu rekonstruieren. ... So berichten im zweiten Kapitel, welches die Überschrift "Grabbauten der Treverer und Mediomatriker" trägt, Klaus-Peter Henz und Anja Klöckner über Grabmäler bei Tholey im Saarland (S. 69-88), stellt Steven Ditsch Grabbauten des 2. und 3. Jh. n. Chr. aus der Pfalz vor (S. 89-107) und beschäftigt sich Gabrielle Kremer mit kaiserzeitlichen Grabmälern des Mosel- und Rheingebietes, wobei sie ihr Hauptaugenmerk auf den Grabbau von Mersch richtet (S. 109-135). Das Kapitel beschließt Markus Siedow, der mit Kammern versehene Grabbauten aus dem Trierer Raum behandelt (S. 137-164). Die verschiedenen Artikel setzen inhaltlich voneinander abweichende Schwerpunkte. ...
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