Refine
Year of publication
- 2019 (3305) (remove)
Document Type
- Article (1597)
- Part of Periodical (400)
- Book (265)
- Doctoral Thesis (211)
- Contribution to a Periodical (195)
- Part of a Book (182)
- Preprint (163)
- Review (141)
- Working Paper (96)
- Conference Proceeding (35)
Language
- English (1828)
- German (1314)
- Portuguese (67)
- French (31)
- Multiple languages (23)
- Turkish (16)
- Spanish (15)
- Italian (5)
- Ukrainian (4)
- mis (2)
Is part of the Bibliography
- no (3305) (remove)
Keywords
- Literatur (69)
- Deutsch (61)
- taxonomy (60)
- Experiment (47)
- Sprache (33)
- new species (32)
- Literarisches Experiment (30)
- Deutsch als Fremdsprache (27)
- Geschichte (25)
- Digitalisierung (23)
Institute
- Medizin (574)
- Präsidium (346)
- Physik (291)
- Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) (189)
- Informatik (159)
- Wirtschaftswissenschaften (144)
- Biowissenschaften (117)
- Sustainable Architecture for Finance in Europe (SAFE) (106)
- Gesellschaftswissenschaften (104)
- Neuere Philologien (90)
Die wissenschaftliche Vernetzung, Betreuung und Unterstützung in der Promotionsphase steht im Zentrum dieser Forschungsarbeit, für die eine soziale Netzwerkanalyse (SNA) zur Karriereentwicklung in einem Bildungsforschungsprogramm in Deutschland durchgeführt wurde. Als Ausgangsproblem wird die schwierige Situation der unsicheren beruflichen Perspektiven Promovierter aufgegriffen.
Die Arbeit beschäftigt sich mit der Frage, wie Promovierende sowohl eine hohe fachliche Qualifikation erreichen, die für eine wissenschaftliche Karriere erforderlich ist, als auch eine gute Vernetzung in der wissenschaftlichen Gemeinschaft aufbauen können, um sich Chancen für die nächsten Karriereschritte zu eröffnen. Aus der Perspektive der Promovierten werden Chancen und Risiken der Vernetzung behandelt, um Überlegungen zu förderlichen und hinderlichen Aspekten der Betreuung und Unterstützung anzustellen.
Die Ergebnisse dieser Forschungsarbeit zeigen auf, welche Bedeutung soziale Netzwerke in der Berufsbiografie haben können und wie wissenschaftliches und soziales Kapital für die Karriere genutzt werden kann. Dazu richtet sich die erziehungswissenschaftliche Perspektive auf Prozesse des Wissenserwerbs und gemeinschaftlicher Lernprozesse, die zur Qualifizierung dienen und unterschiedliche Modelle von Betreuung umfassen. Im Verlauf der Promotionsphase und der weiteren wissenschaftlichen Karriere beginnen die Promovierenden auf der Wissensgrundlage ihres Studiums als Neulinge ihre erste umfangreiche empirische Forschungsarbeit. Sie werden durch die Mitarbeit im Projekt und ihre Beteiligung an Aktivitäten an die Arbeitsweisen in der Wissenschaft herangeführt. Von einer solchen eher randständigen Position aus erwerben sie Wissen, lernen hinzu, tauschen sich mit fortgeschrittenen WissenschaftlerInnen aus und sammeln eigene Erfahrungen. Nach einiger Zeit weiterer Qualifizierung und größerer Sichtbarkeit in der wissenschaftlichen Gemeinschaft können sie Positionen näher am Zentrum ihres Forschungsgebiets einnehmen, die auf ihren Kenntnissen und ihrer zunehmenden fachlichen und methodischen Expertise beruhen.
Neue Erkenntnisse über Betreuungsmodelle sind hilfreich, denn die Betreuung orientiert sich mal stark an dem klassischen Lehrer-Schüler-Modell (Individualbetreuung) oder an einer gemeinsamen Betreuung in einer Forschungsgruppe (Gruppenbetreuung). Die Untersuchung der Bedeutung von sozialem Kapital und situiertem Lernen in der Qualifikationsphase dient dazu, die Vernetzung von Promovierten in ihrer späteren akademischen Karriere zu analysieren.
Transposable elements (TEs) are replicating genetic elementst hat comprise up to 50% of mammalian genomes. A specific class of TEs are retrotransposons that proliferate by transcription into a RNA intermediate, followed by genomic reintegration into another locus (so called “copy & paste” mechanism). Due to the lack of removal mechanisms and very rare parallel insertions, the presence of TE insertions at ortholgous genomic loci in multiple taxa provides a virtually homoplasy free phylogenetic marker. So far, developing phylogenetically informative markers from TE insertions has been a tedious work of testing hundreds of putative candidate loci in a trial-and error approach with low success rate. Hence, phylogenetic studies using TE insertions were often limited to a few dozen markers.
Recently, genome sequencing of multiple species using reference-mapping allowed the identification of genome-scale datasets of TE insertions. and made the ad-hoc development of phylogenetic informative markers possible. However, genome scale TE detection methods have rarely been applied to non model organisms in which data availability and quality is comparably limited. In this thesis, I developed the TeddyPi pipeline (TE detection and discovery for phylogenetic inference), a software tool that made it possible to obtain reliable genome-scale TE insertion data from low-coverage genomes. This was achieved by integrating the data from multiple TE and structural variation callers as well as applying a stringent filtering pipeline to exclude low-quality insertion calls. Whole-genome sequencing datasets of bears (Ursidae) and baleen whales (Mysticeti) were used to apply TE based phylogenetic inference and evaluate the method in comparison to sequence-based phylogenomic analyses.
In the bear genomes, TeddyPi identified 150,513 high-quality transposable element (TE) insertions, which allowed me to reconstruct the evolutionary history of bears despite extensive phylogenetic conflict (Lammers et al., 2017). The large number of detected TE insertions made also detailed network analyses possible that visualize the phylogenetic conflict. Experimental polymerase chain reaction (PCR) assays validated up to 93 % of the computationally identified TE loci and demonstrated the high accuracy of the dataset underlying the phylogenetic analyses.
Second, I present the initial genome sequencing of six baleen whales and a detailed investigation of their evolutionary history using TE insertions and established sequence-based phylogenomic methods. The taxon sampling of baleen whales included iconic species like the blue whale (Balaneoptera musculus) or the humpback whale (Megaptera novaengliae) (Árnason et al., 2018). A sequence-based reconstruction of the baleen whale species tree solved the long-debated phylogenetic position of the gray whale (Echrichtius robustus) within rorquals (Balaneopteridae) for the first time with high statistical support. Furthermore, the genome data made it possible to identify large extent of phylogenetic conflict for divergences during the radiation of rorquals that occurred 7-10 million years ago (Ma).
The phylogenomic analyses of 91,589 TE insertions in the whale genomes confirmed the sequence-based topology (Lammers et al., 2019). The quantification of phylogenetic signals obtained from the TE insertions revealed a high degree of discordance for the divergence of the gray whale and rorquals. Despite the large genome-scale dataset, statistical tests showed only marginal support for a bifurcating divergence of gray whales and the rorqual species. The limited statistical support for a strictly bifurcating tree obtained from genome-scale datasets of thousands of markers demonstrates the importance for including phylogenetic networks for displaying evolutionary divergences.
In conclusion, this thesis shows that identification of TE insertions from whole-genome resequencing provides plentiful and accurate phylogenomic markers. For the application in non model organisms, I provide a easy-to-use software to integrate multiple datasets from TE and structural variation callers in order to obtain reliable and ascertainment-bias free datasets. Detecting genome-scale datasets of TE insertions in two case studies demonstrates the applicability of this marker system for phylogenetic reconstruction and inferring phylogenetic conflict.
Nominal modification in language production: Extraposition of prepositional phrases in german
(2019)
In my dissertation, I investigate the phenomenon of extraposition of PP out of NP in German in language production. Four production experiments, using the method of production of memory, and three experiments testing the acceptability of extraposition were conducted. In extraposition, a constituent is realized in a position to the right of what would be considered the canonical position. A special case is extraposition out of a nominal phrase (NP), in which a constituent is moved out of NP to the end of the utterance. The example in (1a) illustrates the canonical version, in which a prepositional phrase (PP) is adjacent to its head noun. In (1b) the PP is extraposed out of NP to the right edge of the sentence.
(1) a. Gestern hat eine Frau mit einer lauten, schrillen Stimme angerufen.
b. Gestern hat eine Frau angerufen mit einer lauten, schrillen Stimme.
There are two main aspects to consider: the length of the extraposed constituent (the PP), and the length of the intervening material. Experiment 1 investigated the influence of constituent length on extraposition. The hypothesis is that longer and more complex constituents are harder to produce and are therefore produced towards the end of the utterance. In the experiment, PPs of three different lengths (2-3, 5-6, 9-11 words) had to be reproduced in either adjacent or extraposed position. As to the length of the intervening material, the hypothesis is that sentences with more intervening material between head noun and extraposed PP will tend to be reproduced with the PP in adjacent position to the head noun. In order to test this hypothesis, the length of the intervening material (1, 2 and 4 words) was manipulated in Experiment 2. The same material was used in an acceptability experiment, using the method of magnitude estimation (Experiment 5).
Previous studies found that extraposition is preferred over verbal material only, thus Experiment 3 investigated the influence of different lengths of purely verbal intervening material. Experiment 4 was concerned with the differences between PP and RC extraposition in production.
Experiment 6 and 7 used Likert scales to assess the acceptability of extraposition. Experiment 6 investigated whether the acceptability of extraposition is influenced by the definiteness status of the NP out of which is extraposed and if a soft constraint for definiteness can be found for PP extraposition in German. Experiment 7 asked if the inner structure of the extraposed constituent (PP only vs. PP+RC) influences its acceptability. An extraposed PP that includes an RC should be "heavier" than a PP without an RC, since the number of phrasal nodes is higher. If indeed heavier constituents are realized at the end of an utterance, the acceptability of an extraposed PP that includes an RC should be higher than that of an extraposed PP without one.
The results of the production experiments show that sentences are mostly reproduced in their original linear sequence, which suggests that extraposed position seems to be just as canonical as adjacent position, especially when extraposition takes place over verbal material only. With regard to constituent length, in extraposed position long PPs are shortened less often, supporting the hypothesis that longer and more complex constituents tend to be produced at the end of the utterance. Recency effects were found for intervening material as participants dropped intervening material rather than change syntactic position of constituents. The length and type of the intervening material is important with respect to how much intervening material is acceptable. Verb clusters were not shortened in sentences with extraposed PPs, however, 1⁄3 of adverbs and 1⁄2 of PP adverbials including a lexical NP were shortened to „verb only“. Extraposed PPs are more often reproduced in adjacent position than adjacent PPs are reproduced in extraposed position. However, the position of RCs is more often changed from adjacent to extraposed than from extraposed to adjacent.
While producing extraposed PPs seems not to be any more difficult than producing adjacent ones, adjacent constituents are consistently rated higher than extraposed constituents in grammaticality judgment tasks. This is in line with findings of Konieczny (2000) on German RC extraposition. The number of phrasal nodes, as suggested by Rickford et al. (1995), did not have an influence on the acceptability of extraposition, while the length of the constituent, measured in words, seems to play a role. Definiteness had no effect on adjacent PPs, but when the PP was extraposed, sentences with an indefinite antecedent were rated higher than sentences with a definite antecedent. This suggests that there is a "soft constraint" for definiteness with regard to PP extraposition out of NP in German.
Buchbesprechungen
(2019)
Es werden folgende Publikation rezensiert: Daniel Barthélémy (Hrsg.): Pl@ntNet; Bunzel-Drüke et al.: Naturnahe Beweidung und Natura 2000; Martina D'Ascola: 50 sagenhafte Naturdenkmale in Hessen; Hessisches Landesamt für Naturschutz, Umwelt und Geologie: Guter Heinrich, Pfingst-Nelke, Färber-Scharte & Co. Hessische Verantwortungsarten – Teil 1.
Die von Wolfgang Ludwig hinterlassene Pflanzensammlung im Marburger Herbar wurde aufbereitet und dokumentiert. Vorgestellt werden Belege aus der in über 70 Jahren (1938–2010) entstandenen Sammlung, die für die hessische Flora bislang nicht bekannt waren sowie Belege zu inzwischen ausgestorbenen, sehr seltenen oder sonstigen bemerkenswerten Arten.
Das Naturschutzgebiet Kühkopf-Knoblochsaue mit 2 400 ha überflutbarer Aue eignet sich in dem potenziellen Wildreben-Verbreitungsgebiet in Deutschland (Oberrheingebiet zwischen Freiburg und Wiesbaden) aktuell bei weitem am besten zum Wiederaufbau überlebensfähiger, ausreichend heterozygoter Wildrebenbestände. Nach einer ersten Wiederansiedlung 2013 mit 65 Genotypen und 121 ausgebrachten wurzelnackten Pflanzen mit Draht-Verbissschutz wurden 2016 in einer zweiten Wiederansiedlungsmaßnahme 551 Wilde Weinreben (78 Genotypen) an 12 Standorten gepflanzt. Es handelte sich hierbei um zweijährige Topfpflanzen, die ohne Verbissschutz gepflanzt wurden. Ein Jahr nach der Pflanzung war eine durchschnittliche Überlebensrate von 69 % zu konstatieren. Die Überlebensraten variieren an den Standorten zwischen 55 und 87 %. 75 von Wildschweinen herausgewühlte Wilde Weinreben wurden wieder eingepflanzt; die Überlebensrate kann somit noch über 69 % steigen.
Bei einer Prüfung von 153 Gewässern in Frankfurt am Main wurden neben den heimischen Typha-Arten Typha angustifolia und T. latifolia Verwilderungen von Typha shuttleworthii und Pflanzungen von Typha laxmannii gefunden. Auch Typha ×glauca die Hybride zwischen Typha angustifolia und T. latifolia wurde mehrfach gefunden.
Im Rahmen der Kartierung der Gefäßpflanzenflora des Vor-, Hochund kammnahen Hintertaunus wurde im Jahre 2004 ein großer Bestand des für Deutschland bislang selten erwähnten Doronicum ×willdenowii entdeckt. Da sich die Art bis heute nicht nur gehalten, sondern vermehrt hat, besteht offensichtlich ein Trend zur lokalen Einbürgerung.
Im Jahr 2008 wurden im Hochtaunus zwei Vorkommen der für diesen Bereich in der Literatur bisher nicht erwähnten Süßdolde (Myrrhis odorata) entdeckt. Beide haben sich bis heute (2017) in dicht geschlossenen, einmal im Jahr gemähten Pflanzenbeständen gehalten. Die Art besitzt also offensichtlich das Potential zur Einbürgerung, wobei man angesichts der relativ geringen Bestandesgröße noch nicht von einem gesicherten Trend zur Einbürgerung sprechen darf. Beide Pflanzenbestände sind saumartig ausgebildet, wobei der Aspekt auch von typischen Saumarten bestimmt wird. Der für Saumgesellschaften auffallend hohe Anteil an Wiesenarten dürfte darauf zurückzuführen sein, dass beide Säume einmal im Jahr gemäht werden.