Virtual screening for PPAR-gamma ligands using the ISOAK molecular graph kernel and gaussian processes

For a virtual screening study, we introduce a combination of machine learning techniques, employing a graph kernel, Gaussian process regression and clustered cross-validation. The aim was to find ligands of peroxisome-proliferator activated receptor gamma (PPAR-y). The receptors in the PPAR family belong to the steroid-thyroid-retinoid superfamily of nuclear receptors and act as transcription factors. They play a role in the regulation of lipid and glucose metabolism in vertebrates and are linked to various human processes and diseases. For this study, we used a dataset of 176 PPAR-y agonists published by Ruecker et al. ...

Metadaten
Verfasserangaben:	Timon Schroeter, Matthias Rupp, Katja Hansen, Klaus-Robert Müller, Gisbert Schneider ORCiD GND
URN:	urn:nbn:de:hebis:30-66720
DOI:	https://doi.org/10.1186/1752-153X-3-S1-P15
ISSN:	1752-153X
Titel des übergeordneten Werkes (Englisch):	Chemistry central journal
Verlag:	BioMed Central
Verlagsort:	London
Dokumentart:	Wissenschaftlicher Artikel
Sprache:	Englisch
Jahr der Fertigstellung:	2009
Datum der Erstveröffentlichung:	05.06.2009
Veröffentlichende Institution:	Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg
Urhebende Körperschaft:	4th German Conference on Chemoinformatics, Goslar, Germany. 9–11 November 2008
Datum der Freischaltung:	26.08.2009
Freies Schlagwort / Tag:	Gaussian Process; Multiple Kernel; Support Vector Regression; Support Vector Regression Model; Virtual Screening
Jahrgang:	3
Ausgabe / Heft:	Supplement 1, P15
Seitenzahl:	2
Erste Seite:	1
Letzte Seite:	2
Bemerkung:	© 2009 Schroeter et al; licensee BioMed Central Ltd.
Quelle:	4th German Conference on Chemoinformatics Goslar, Germany. 9–11 November 2008 ; Chemistry Central Journal 2009, 3(Suppl 1):P15 ; doi:10.1186/1752-153X-3-S1-P15 ; http://www.journal.chemistrycentral.com/content/3/S1/P15
HeBIS-PPN:	21515794X
Institute:	Biochemie, Chemie und Pharmazie / Biochemie und Chemie
DDC-Klassifikation:	5 Naturwissenschaften und Mathematik / 54 Chemie / 540 Chemie und zugeordnete Wissenschaften
Lizenz (Deutsch):	Deutsches Urheberrecht

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