Das Suchergebnis hat sich seit Ihrer Suchanfrage verändert. Eventuell werden Dokumente in anderer Reihenfolge angezeigt.
  • Treffer 19 von 20
Zurück zur Trefferliste

A consensus compound/bioactivity dataset for data-driven drug design and chemogenomics

  • Publicly available compound and bioactivity databases provide an essential basis for data-driven applications in life-science research and drug design. By analyzing several bioactivity repositories, we discovered differences in compound and target coverage advocating the combined use of data from multiple sources. Using data from ChEMBL, PubChem, IUPHAR/BPS, BindingDB, and Probes & Drugs, we assembled a consensus dataset focusing on small molecules with bioactivity on human macromolecular targets. This allowed an improved coverage of compound space and targets, and an automated comparison and curation of structural and bioactivity data to reveal potentially erroneous entries and increase confidence. The consensus dataset comprised of more than 1.1 million compounds with over 10.9 million bioactivity data points with annotations on assay type and bioactivity confidence, providing a useful ensemble for computational applications in drug design and chemogenomics.

Volltext Dateien herunterladen

Metadaten exportieren

Metadaten
Verfasserangaben:Laura IsigkeitORCiD, Apirat ChaikuadORCiD, Daniel MerkORCiDGND
URN:urn:nbn:de:hebis:30:3-795795
DOI:https://doi.org/10.3390/molecules27082513
ISSN:1420-3049
Titel des übergeordneten Werkes (Englisch):Molecules
Verlag:MDPI
Verlagsort:Basel
Dokumentart:Wissenschaftlicher Artikel
Sprache:Englisch
Datum der Veröffentlichung (online):13.04.2022
Datum der Erstveröffentlichung:13.04.2022
Veröffentlichende Institution:Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg
Datum der Freischaltung:21.11.2023
Freies Schlagwort / Tag:big data; data curation; de novo design; machine learning; medicinal chemistry
Jahrgang:27
Ausgabe / Heft:8, art. 2513
Aufsatznummer:2513
Seitenzahl:13
Erste Seite:1
Letzte Seite:13
Bemerkung:
This project has received funding from the Innovative Medicines Initiative 2 Joint Undertaking (JU) under grant agreement No. 875510. The JU receives support from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation program, EFPIA, Ontario Institute for Cancer Research, Royal Institution for the Advancement of Learning McGill University, Kungliga Tekniska Hoegskolan, and Diamond Light Source Limited.
Bemerkung:
The consensus dataset generated and analyzed in this study is freely available from Zenodo (https://zenodo.org), with the doi:10.5281/zenodo.6398019.
HeBIS-PPN:516701916
Institute:Biochemie, Chemie und Pharmazie
Fachübergreifende Einrichtungen / Buchmann Institut für Molekulare Lebenswissenschaften (BMLS)
DDC-Klassifikation:5 Naturwissenschaften und Mathematik / 54 Chemie / 540 Chemie und zugeordnete Wissenschaften
Sammlungen:Universitätspublikationen
Lizenz (Deutsch):License LogoCreative Commons - CC BY - Namensnennung 4.0 International

OPUS4 Logo