Structure validation of G‐rich RNAs in noncoding regions of the human genome
- We present the rapid biophysical characterization of six previously reported putative G‐quadruplex‐forming RNAs from the 5′‐untranslated region (5′‐UTR) of silvestrol‐sensitive transcripts for investigation of their secondary structures. By NMR and CD spectroscopic analysis, we found that only a single sequence—[AGG]2[CGG]2C—folds into a single well‐defined G‐quadruplex structure. Sequences with longer poly‐G strands form unspecific aggregates, whereas CGG‐repeat‐containing sequences exhibit a temperature‐dependent equilibrium between a hairpin and a G‐quadruplex structure. The applied experimental strategy is fast and provides robust readout for G‐quadruplex‐forming capacities of RNA oligomers.
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| Verfasserangaben: | Oliver BinasORCiDGND, Irene BessiORCiDGND, Harald SchwalbeORCiDGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hebis:30:3-564929 |
| DOI: | https://doi.org/10.1002/cbic.201900696 |
| ISSN: | 1439-7633 |
| ISSN: | 1439-4227 |
| Titel des übergeordneten Werkes (Deutsch): | ChemBioChem |
| Verlag: | Wiley-VCH Verlag GmbH & Co. KGaA. |
| Verlagsort: | Weinheim |
| Dokumentart: | Wissenschaftlicher Artikel |
| Sprache: | Englisch |
| Datum der Veröffentlichung (online): | 14.01.2020 |
| Datum der Erstveröffentlichung: | 14.01.2020 |
| Veröffentlichende Institution: | Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg |
| Datum der Freischaltung: | 28.10.2020 |
| Freies Schlagwort / Tag: | G-quadruplexes; NMR spectroscopy; RNA; biophysical investigation; circular dichroism |
| Jahrgang: | 21 |
| Ausgabe / Heft: | Issue Horst Kessler’s 80th Birthday |
| Seitenzahl: | 8 |
| Erste Seite: | 1656 |
| Letzte Seite: | 1663 |
| HeBIS-PPN: | 471418374 |
| Institute: | Biochemie, Chemie und Pharmazie / Biochemie und Chemie |
| DDC-Klassifikation: | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 54 Chemie / 540 Chemie und zugeordnete Wissenschaften |
| 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie | |
| Sammlungen: | Universitätspublikationen |
| Lizenz (Deutsch): |  Creative Commons - Namensnennung 4.0 |
