HEATSTER : a database and web server for identification and classification of heat stress transcription factors in plants
- Heat stress transcription factors (HSFs) regulate transcriptional response to a large number of environmental influences, such as temperature fluctuations and chemical compound applications. Plant HSFs represent a large and diverse gene family. The HSF members vary substantially both in gene expression patterns and molecular functions. HEATSTER is a web resource for mining, annotating, and analyzing members of the different classes of HSFs in plants. A web-interface allows the identification and class assignment of HSFs, intuitive searches in the database and visualization of conserved motifs, and domains to classify novel HSFs.
Verfasserangaben: | Jannik Berz, Stefan SimmORCiDGND, Sebastian Schuster, Klaus-Dieter Scharf, Enrico SchleiffORCiDGND, Ingo EbersbergerORCiDGND |
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URN: | urn:nbn:de:hebis:30:3-492870 |
DOI: | https://doi.org/10.1177/1177932218821365 |
ISSN: | 1177-9322 |
Pubmed-Id: | https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/30670918 |
Titel des übergeordneten Werkes (Englisch): | Bioinformatics and biology insights |
Verlag: | Sage Publications |
Verlagsort: | Thousand Oaks, CA |
Dokumentart: | Wissenschaftlicher Artikel |
Sprache: | Englisch |
Jahr der Fertigstellung: | 2019 |
Datum der Erstveröffentlichung: | 07.01.2019 |
Veröffentlichende Institution: | Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg |
Datum der Freischaltung: | 28.02.2019 |
Freies Schlagwort / Tag: | HSF; database; heat stress; motif search |
Jahrgang: | 13 |
Seitenzahl: | 5 |
Erste Seite: | 1 |
Letzte Seite: | 5 |
Bemerkung: | Creative Commons Non Commercial CC BY-NC: This article is distributed under the terms of the Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 License (http://www.creativecommons.org/licenses/by-nc/4.0/) which permits non-commercial use, reproduction and distribution of the work without further permission provided the original work is attributed as specified on the SAGE and Open Access pages (https://us.sagepub.com/en-us/nam/open-access-at-sage). |
HeBIS-PPN: | 446477192 |
Institute: | Biowissenschaften / Biowissenschaften |
Angeschlossene und kooperierende Institutionen / Senckenbergische Naturforschende Gesellschaft | |
Fachübergreifende Einrichtungen / Biodiversität und Klima Forschungszentrum (BiK-F) | |
Exzellenzcluster / Exzellenzcluster Makromolekulare Komplexe | |
Wissenschaftliche Zentren und koordinierte Programme / Frankfurt Institute for Advanced Studies (FIAS) | |
DDC-Klassifikation: | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 58 Pflanzen (Botanik) / 580 Pflanzen (Botanik) |
Sammlungen: | Universitätspublikationen |
Open-Access-Publikationsfonds: | Biowissenschaften |
Lizenz (Englisch): | Creative Commons - Namensnennung-Nicht kommerziell 4.0 |