Redirection of the transcription factor SP1 to AT rich binding sites by a synthetic adaptor molecule
- The ubiquitous transcription factor SP1 binds to a GC rich consensus sequence. Here we describe an adaptor molecule that mediates binding of SP1 to a non-cognate DNA site rich in AT. The adaptor is comprised of a Dervan-type hairpin polyamide with high affinity to an AT rich hexamer duplex. It also carries a 27mer DNA that contains the SP1 consensus sequence. The synthesis and purification of the polyamide-DNA conjugate is reported. Pulldown experiments and western blot analysis demonstrate adaptor mediated binding of SP1 to the hexamer duplex TTGTTA.
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| Verfasserangaben: | Mathias Bolz, Ute Scheffer, Elisabeth Kalden, Michael GöbelORCiDGND |
|---|---|
| URN: | urn:nbn:de:hebis:30:3-626529 |
| DOI: | https://doi.org/10.1002/hlca.202100095 |
| ISSN: | 1522-2675 |
| Titel des übergeordneten Werkes (Englisch): | Helvetica chimica acta |
| Verlag: | Wiley-VCH |
| Verlagsort: | New York, NY |
| Dokumentart: | Wissenschaftlicher Artikel |
| Sprache: | Englisch |
| Datum der Veröffentlichung (online): | 08.08.2021 |
| Datum der Erstveröffentlichung: | 08.08.2021 |
| Veröffentlichende Institution: | Universitätsbibliothek Johann Christian Senckenberg |
| Datum der Freischaltung: | 20.12.2021 |
| Freies Schlagwort / Tag: | DNA conjugate; DNA recognition; adaptor mediated recruitment; hairpin polyamides; protein capture |
| Jahrgang: | 104 |
| Ausgabe / Heft: | 9, art. e2100095 |
| Seitenzahl: | 9 |
| Erste Seite: | 1 |
| Letzte Seite: | 9 |
| Bemerkung: | Open access funding enabled and organized by Projekt DEAL. |
| HeBIS-PPN: | 491320094 |
| Institute: | Biochemie, Chemie und Pharmazie |
| DDC-Klassifikation: | 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 54 Chemie / 540 Chemie und zugeordnete Wissenschaften |
| 5 Naturwissenschaften und Mathematik / 57 Biowissenschaften; Biologie / 570 Biowissenschaften; Biologie | |
| Sammlungen: | Universitätspublikationen |
| Lizenz (Deutsch): |  Creative Commons - Namensnennung 4.0 |
